被冲田总司带回新选组以后，山南敬助始终保持沉默，在面对近藤勇和土方岁三的时候也如此。

新选组的局中法度之一，就是不可以擅自脱离组织，毫无疑问，违反了局中法度的山南敬助，结局只有切腹。终于山南敬助不再沉默，他开口说：“我希望总司帮我介错。”

以往冲田总司和山南敬助之间的关系比较好，在听到山南敬助的请求以后，他并没有表现出多少悲伤的情绪，可能是因为和山南敬助的交情相比，维护新选组的局中法度更为重要。

由于山南敬助在新选组内部很有人缘，是人人敬仰的“山南先生”，所以很多人不希望山南敬助切腹，甚至找到近藤勇求情。但是土方岁三没有对山南敬助网开一面，他必须坚持局中法度，否则局中法度会变成无意义的废纸。

屋子内部只有山南敬助和冲田总司。冲田总司拿出自己的武器，问山南敬助：“山南先生，你有什么遗言吗？”

刚想说自己没有什么遗言，却突然想到某些事情，所以山南敬助没有感情色彩地回应：“早知如此，我应该提前动手，杀了南明的虎亲王。”

冲田总司知道山南敬助和朱永安没有多少交集，因此冲田总司感到震惊，下意识地追问：“为什么？”

山南敬助并不想对冲田总司解释，他利落地解开自己的上衣：“没有为什么，准备动手吧，总司。”

事已至此，冲田总司知道山南敬助去意已决，所以不再追问，而是拔出自己的武器。

没想到山南敬助脱逃失败，伊东甲子太郎最开始有些莫名其妙的恐惧，害怕山南敬助切腹之前把自己给供出来，结果伊东甲子太郎的担心是多余的。山南敬助切腹以后，新选组再无总长。